Medal of Honor Limited Edition est un jeu pc d'Action. L'histoire commence l'année 2002, pendant les jours d'ouverture de l'invasion de l'Afghanistan. Tier 1 des opérateurs d'une escouade de Navy SEAL DEVGRU, indicatif d'appel de Neptune, composé des opérateurs au nom de code Mother, Voodoo, Preacher et Rabbit sont envoyés pour rencontrer un informateur afghan nommé Tariq, qui a l'intelligence. Neptune est en embuscade par les forces tchétchènes, et les combats leur chemin à travers le village pour récupérer Tariq. Peu de temps après l'extraction, Tariq les informe que les talibans et Al-Qaïda ont constitué une force importante de 500 à 1.000 combattants dans la vallée de Shah-i-Kot. Neptune est chargé de sécuriser l'aérodrome de Bagram avec un contingent de soldats de l'ANA. En Mars 2002, l'aérodrome est reciblées comme une base d'opérations avancée par les forces de l'OTAN.
Le gameplay est conçu pour être authentique, comme EA avait embauché plusieurs consultants de l'armée des États-Unis afin de donner l'inspiration aux développeurs. Le jeu est vaguement basé sur des parties de l'opération Anaconda, plus précisément, les événements entourant la bataille de Roberts Ridge.
